Vogelbescherming zet zich actief in voor de bescherming van de gehele internationale vogeltrekroute waarvan de Waddenzee een van de belangrijkste plekken is (de Oost-Atlantische flyway). Hierbij richten we ons op de monitoring langs de trekroute, aanleg, inrichting en het herstel van broed-, voedsel- en rustgebieden voor vogels en het versterken van het beheer van belangrijke natuurgebieden op de trekroute. De nadruk ligt vooral op de West-Afrikaanse overwinteringsgebieden. Hiervoor werken we nauw samen met verschillende partijen.
Geregeld worden hiervoor internationale simultaantellingen georganiseerd, onder leiding van Sovon Vogelonderzoek Nederland. Naast de tellingen is ook nader onderzoek nodig naar bijvoorbeeld oorzaken van mogelijke afnames, om zo gericht beschermingsmaatregelen te kunnen nemen of te adviseren.
We beschermen de vogeltrekroute verder actief door deelname aan het Wadden Sea Flyway Initiative - een samenwerking tussen Nederland, Duitsland en Denemarken en het Coastal Migratory Birds-project van BirdLife International in West-Afrika. In beide laatst genoemde projecten heeft Vogelbescherming een belangrijke rol.
Veel broedvogelpopulaties gaan achteruit in het Waddengebied. In natuurlijke systemen is er áltijd sprake van schommelingen in broedsucces en overleving. Maar als de leefomgeving structureel verslechterd, kan het op de lange termijn misgaan met soorten, bijvoorbeeld door predatie, overstromen van broedplekken en afname van het voedselaanbod. Daarom werken we actief, samen met beheerders en overheden, aan het verbeteren van het broedsucces. In 2018 is Actieplan Broedvogels Waddenzee opgesteld, dat via Wij&Wadvogels uitgevoerd wordt. Vogelbescherming speelt daarbij een leidende rol.
Vogelbescherming heeft met haar BirdLife Partners in Duitsland en Denemarken een gezamenlijke visie op het herstel en de bescherming van de internationale Waddenzee ontwikkeld. Het doel van deze visie is het herstel en behoud van ecosystemen in de Waddenzee en langs de trekroute naar Afrika. Daarnaast het creëren van broed- en hoogwatervluchtplaatsen en weerbaar maken van de waddennatuur tegen de effecten van klimaatverandering.
Vogelbescherming helpt onderzoek te financieren naar vogelsoorten in het Waddengebied. De ontwikkelingen worden voortdurend onderzocht, gemonitord en geëvalueerd. Wetenschappelijk onderzoek is de basis van het werk van Vogelbescherming.
Enkele vogelsoorten waarnaar Vogelbescherming specifiek onderzoek liet verrichten zijn scholekster, tapuit, blauwe kiekendief, velduil, noordse stern en visdief. De onderzoeksvragen richten zich vooral op de oorzaken van achteruitgang en de mogelijkheden voor herstel.
Voorbeelden van onderzoek dat mede mogelijk werd gemaakt door Vogelbescherming: